化學基因組學

化學基因組學

图书基本信息
出版时间:2008-4
出版社:科學出版社
作者:DARVAS 編
页数:206
书名:化學基因組學
封面图片
化學基因組學
内容概要
本書由該領域的國際知名專家撰寫,是第一本全面的化學基因組學專著,全面討論了化學基因組學的各個專題,以及從相關計算機芯片到實驗等的相關技術。第一部分描述了化學基因組學的定義和基本概念,包括從計算機芯片化學基因組學到基于芯片微陣列等的主要技術。第二部分專注于特殊技術,討論了小分子探針研究特異基因產物方法的出現和應用實例。最後3章是藥物發現相關領域的研究實例,進一步強調了化學基因組學是多個研究方向相互關聯的綜合性研究方法,如脂質組學、神經遞質的藥學基因組學方向,以及DNA專利的近似線性配對算法。    本書可供藥物化學、分子生物學、生物信息學等專業科研人員參考,也可作為藥物化學專業教材使用。
书籍目录
前言第1章  什麼是化學基因組學?第2章  芯片上的化學基因組學  2.1 引言  2.2 將計算機技術應用到化學基因組學    2.2.1 蛋白質結構    2.2.2 蛋白質的同源模建    2.2.3 選擇適當的小分子    2.2.4 蛋白質功能的預測  2.3 案例研究    2.3.1 同源模型構建    2.3.2 基于蛋白質序列的方法    2.3.3 基于蛋白質結構的方法  參考文獻第3章  化學基因組學過程的優化  3.1 引言  3.2 化學基因組學的化合物庫    3.2.1 化學基因組學化合物庫的設計    3.2.2 化合物質量    3.2.3 數據分析及整合  3.3 篩選進展︰化學基因組學途徑    3.3.1 靶點的產生    3.3.2 分析平台    3.3.3 離子通道篩選的化學基因組學方法    3.3.4 確立設計一個持久有效的分析過程    3.3.5 重要的動力學因素    3.3.6 分析過程的穩定性以及驗證    3.3.7 小結  3.4 HTS技術及過程    3.4.1 選擇HTS平台    3.4.2 該途徑的量度(n個靶點×y個化合物)      3.4.3 假陽性和假陰性可接受的比率    3.4.4 合適的精密度和準確性    3.4.5 來自不同篩選階段的數據信息    3.4.6 HTS平台與化合物處理的整合  3.5 結論  致謝  參考文獻第4章  化學基因組學中基于微芯片技術的高通量篩選  4.1 引言  4.2 微陣列    4.2.1 轉錄組學(transcriptomics)︰DNA陣列    4.2.2 化學基因組學︰小分子陣列    4.2.3 蛋白質組學︰大分子陣列    4.2.4 基于細胞的陣列︰細胞組學方法    4.3 微流體  4.4 小結與展望  致謝  參考文獻第5章  小分子在化學基因組學中的應用︰有前景的高通量方法  5.1 引言  5.2 小分子在化學基因組學/蛋白質組學中︰單一化合物方法與文庫方法    5.2.1 單個化合物作為探詢配體    5.2.2 化合物庫  5.3 庫的設計與選擇    5.3.1 化學基因組學中小分子探針的設計    5.3.2 基于組合片段的設計    5.3.3 動態配體自組裝    5.3.4 用于產生選擇性GPCR配體的多結合位點方法    5.3.5 用于設計篩選片段的Graffinity方法    5.3.6 基于片段的高通量結晶    5.3.7 ADME傾向性的設計︰透膜小分子庫  5.4 復用與高通量技術    5.4.1 高通量基于細胞的檢測(細胞陣列)    5.4.2 反向雙雜交體系      5.4.3 平行親和柱分離      5.4.4 平行凝膠排阻色譜法(parallel size-exclusion chromatography)︰復雜混合物中快速親和選擇    5.4.5 化學微陣列    5.4.6 組合tehtering用液相平行合成  5.5 小結  致謝  參考文獻第6章  用于快速蛋白質鑒定的多功能光探針  6.1 引言  6.2 主要光活性基團的化學性質  6.3 提高光親和標記通量的生物素化重氮甲烷  6.4 在固態基質上的光親和標記  參考文獻第7章  定義脂質組︰一個新的治療靶標  7.1 引言  7.2 治療學中主要的脂質組學靶標    7.2.1 磷酸肌醇    7.2.2 神經鞘脂類    7.2.3 溶血磷脂類  7.3 脂質組分析的方法    7.3.1 分析型脂質組學    7.3.2 功能性脂質組學  7.4 結語  參考文獻第8章  多巴胺能神經遞質相關的基因多態性的藥物毒理學表現  8.1 多巴胺系統的概述    8.1.1 多巴胺的合成、功能和代謝    8.1.2 主要多巴胺能系統及與精神病理學的關聯    8.1.3 多巴胺系統的遺傳藥理學  8.2 鑒定基因多態性的方法  8.3 多巴胺受體    8.3.1 多態的多巴胺D2受體基因      8.3.2 多巴胺D2受體的遺傳藥理學    8.3.3 多巴胺D3受體基因的多態性    8.3.4 多巴胺D3受體基因的遺傳藥理學    8.3.5 高多態的多巴胺D4受體基因    8.3.6 多巴胺D4受體的遺傳藥理學  8.4 多巴胺轉運體    8.4.1 多巴胺轉運體及其變異體    8.4.2 多巴胺轉運體的遺傳藥理學  參考文獻第9章  用于藥學產業中DNA專利申請評估的近似線性配對算法  9.1 引言  9.2 結果  9.3 結論  參考文獻
章节摘录
  第1章 什么是化学基因组学?  对于生物学的探索不仅要靠科学探索精神,更需要生物或者化学工具的操作系统的发展来推动。在20世纪后半叶,生物系统的研究已经从细胞水平上升到分子水平。很多生物(包括人类)的全基因组测序的完成,使人们对生物的理解产生了翻天覆地的变化。现在,着眼于生物体并在器官、组织、细胞、亚细胞及分子水平进行剖析已经不是人们关注的焦点,因为虽然已经在分子水平的研究上达到了相当精密的程度,但是关于这些分子之间的相互作用,以及如何整合在一起作为功能单位的机制还知之甚少。  很多基因水平上的数据和生物学工具在应用上是很有价值的,包括小分子干扰RNA(siRNA)、反义技术(antisense)、基因敲除技术(knock-out)、转基因技术(transgenics)、抗体技术(antibody)及群体遗传学(population genet—ics)。这些技术手段可以针对一个靶基因,也可以针对多个靶基因应用。然而,人类基因组中有约30 000个基因,上述技术不能很好地阐明每个基因的生物功能,同时耗时长,成本昂贵,以及耗费时间和资源。因此,这些生物学工具更基本的应用可能是在基因组子集水平的研究上,以提供充分的数据进行计算并验证相关理论的可靠性。目前对于基因组的许多基因,通过干扰相关基因只能进行很有限地预测分析并推断某个基因的功能。  在应用这些技术确证已知药物的特定蛋白靶标前,药学和基因组学长久以来都是两个相对独立的领域。对于药物与靶点之间相互作用的研究,以及在分子水平上逐步深入地理解靶点在特定生物途径中的作用角色,已使目前市场上的药品数量和性质都有很大的突破。然而,目前基因组中的基因只有很少一部分作为药物的靶标。虽然干扰基因组中一些基因之间的相互作用并不一定会带来治疗上的生理后果,但是并不代表全部重要的药物靶点都已经被确证了。  ……
下载链接

化學基因組學下載

评论与打分
    暂无评论