生物信息與數據處理

生物信息與數據處理

图书基本信息
出版时间:2006-7
出版社:高等教育出版社
作者:徐程
书名:生物信息與數據處理
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生物信息與數據處理
内容概要
本書包括3方面的內容︰(1)以互聯網為基礎的生物資源檢索,主要講述因特網資源類型、因特網資源的查找方式,並簡要介紹因特網中一些重要的生物學站點,此外還重點介紹了與生物相關的網絡文獻數據庫的使用方法,以及通過相關文獻管理軟件構建自己的數據庫的方法;(2)互聯網中生物數據庫,包括常用的核酸蛋白質數據庫、基因組數據庫,同時重點介紹了以文本為搜索依據的數據庫檢索方式和以序列相似性為基礎的數據庫搜索方法; (3)實驗設計的基本原則、統計的基本方法以及生物統計作圖軟件的使用方法。書中設計了9個上機實驗,便于學生通過實際操作掌握生物文獻檢索、互聯網生物資源搜索以及生物統計軟件的使用方法。    本書的目的在于通過對計算機和互聯網相關知識的介紹,使學生掌握互聯網生物資源獲取及分析方法,以增強學生自主學習能力,拓寬學生知識領域,為今後科研實踐打好基礎。本書作為講義已經過5輪教學實踐,具有系統性強、技術方法新、內容豐富、結構緊湊、實用性強等特點,適合于生物科學、生物技術及相關專業的本科生和研究生使用,也可供研究人員參考。
书籍目录
第1章 绪论  1.1 计算机在生命科学领域的应用  1.2 学习本课程的目的与意义  1.3 学习本课程的基本方法第2章 因特网与网上生物学资源  2.1 因特网概述  2.2 因特网的相关概念、提供的服务类型和软件  2.3 网上生物学信息资源分类  2.4 计算机检索原理  2.5 计算机检索基本原理  2.6 生物文献检索途径第3章 搜索引擎与生物学资源导航站点  3.1 Internet上WWW生物资源的查询途径  3.2 搜索引擎的查询方法  3.3 非WWW生物资源检索途径  3.4 因特网涉及生物学习的资源介绍  3.5 引用Internet资源的注意事项 第4章 因特网上的生物学文献数据库  4.1 文献搜索引擎  4.2 生物相关文摘型数据库  4.3 全文数据库介绍  4.4 会议论文数据库  4.5 学位论文数据库  4.6 专利数据库  4.7 标准数据库  4.8 获取原文的方法总结第5章 特定文献数据库的构建  5.1 文献管理软件的共同特点  5.2 Reference Manager软件的使用  5.3 国产文献管理软件——医学文献王简介第6章 文献阅读与综述撰写  6.1 文献阅读的意义和方法   6.2 科技综述的写作第7章 常用核酸蛋白质数据库介绍  7.1 常用核酸和蛋白质数据库及文件格式  7.2 其他注释序列数据库  7.3 基因组和特殊物种数据库  7.4 其他数据库第8章 生物数据库检索  8.1 利用SRS(序列检索系统)搜索数据库   8.2 利用Entrez进行数据库搜索  8.3 DBGET/LinkDB第9章 以序列相似性为准则的数据库搜索  9.1 序列相似性搜索  9.2 氨基酸取代矩阵  9.3 数据库搜索:FASTA和BLAST  9.4 序列过滤  9.5 反复数据库搜索和PSl—BLAST第10章 PRISM统计分析软件的使用  10.1 常用统计软件介绍  10.2 GraptlPad Prism使用介绍上机实验  实验1 常用搜索引擎及专业搜索引擎的使用  实验2 PLlbMed的使用  实验3 常用文献数据库及专业数据库检索  实验4 利用文献管理软件构建文献数据库  实验5 常用分子生物学数据库检索  实验6 利用Erltrez、SRS工具检索相关核酸蛋白数据库  实验7 利用Blast进行数据库相似性搜索  实验8 利用Grapt-iPad Prism 4进行统计分析及作图  实验9 依给定题目进行文献检索并完成文献综述的写作
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