化學圖文設計與分子模擬計算

化學圖文設計與分子模擬計算

图书基本信息
出版时间:2009-3
出版社:華南理工大學出版社
作者:劉江燕,武書彬 編著
页数:347
书名:化學圖文設計與分子模擬計算
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化學圖文設計與分子模擬計算
前言
近十年來,計算機技術在化學化工領域得到了廣泛的應用,計算(機)化學的發展呈現出蓬勃發展的喜人前景。近年來出版了不少計算機化學方面的教材和參考書,但大多側重于與數學密切相關的數值計算方法的介紹。計算機圖形接口技術的廣泛應用,使得化學結構與圖文處理變得如此方便,尤其是大型桌面化學辦公系統軟件ChemOffice版本的不斷更新與升級,量化模擬計算軟件功能的不斷完善,使得我們可以在計算機上輕松地完成許多以往在實驗室才能完成或要通過大量編程才能完成的工作。化學及相關專業學生的計算機應用能力的培養是多方面的,熟悉並掌握一些常用化學軟件的使用,是其計算機應用能力的一個重要方面,是進行畢業設計與撰寫畢業論文的重要基礎。此外,計算機化學模擬是近年來化學、生物及材料研究中十分活躍的領域,未來的化學研究很大程度上需要理論計算的輔助支撐,熟悉並掌握化學模擬計算的一般方法,對于化學工作者來說,也是一種十分必要的知識儲備。本書是為理工科院校化學化工及其相關專業高年級本科生和研究生編寫的,旨在通過本課程的學習,使學生初步掌握化學及相關領域常用軟件的使用技巧,具備從事科學研究的化學圖文設計能力和初步的分子模擬計算能力。本書以最新版桌面化學辦公系統軟件仁ChemBioOffice2008及量化計算軟件包Gaussian03為載體,以化學結構為基礎,以結構-性質-模擬計算為主線,通過大量實例和上機操作練習,詳細介紹了化學圖文設計與分子模擬計算的一般方法,使讀者對計算(機)化學及分子模擬計算有一個初步了解,為進一步的深入學習打下基礎。本書既可作為系統學習的教材,也可作為相關軟件的使用手冊備查,是化學工作者的重要參考書。
内容概要
本書以著名的桌面化學辦公系統軟件ChemBioOffice2008和廣泛使用的量化計算軟件Gaussian03的使用為例,采用圖形界面與文字敘述相對照的方式,詳細介紹了化學圖文設計和分子模擬計算的方法。內容包括︰計算機化學及化學模擬的概念與方法;ChemSketch化學圖文繪制技巧;ChemBioDraw化學生物繪圖工具的使用方法、結構查詢、結構與性質計算;ChemBio3D結構模型構建、修改、顯示與輸出的方法和技巧;ChemBio3D中量子化學接口軟件(MOPAC、Gaussian、Jaguar等)在分子模擬計算中的應用;Gaussian03輸入文件的編制、計算作業的運行、計算結果的觀察等方法;利用GaussView4.1創建、設置、運行與觀察Gaussian輸入輸出文件的方法。書中采用眾多計算實例,介紹了單點能計算、幾何優化計算、頻率計算、高精度計算、化學反應路徑計算、激發態的計算和溶液中的模擬等計算方法和計算結果的查看。    本書可作為化學及相關專業高年級本科生、研究生的教材和化學專業教師及有關研究人員的參考書,也可作為相關軟件的使用參考書。
书籍目录
第1章  計算機與化學 1.1  計算機與化學   1.1.1  計算機化學   1.1.2  計算化學   1.1.3  理論化學   1.1.4  量子化學 1.2  計算機化學的發展 1.3  我國計算(機)化學的發展概況 1.4  分子模擬與量化計算簡介    1.4.1  分子模擬的意義    1.4.2  分子模擬的一般過程    1.4.3  分子模型的構建    1.4.4  分子模擬的方法  1.5  常用化學軟件簡介    1.5.1  化學圖文設計軟件    1.5.2  計算化學與分子模擬軟件    1.5.3  化學數據庫    1.5.4  圖譜解析軟件    1.5.5  數據處理軟件    1.5.6  文獻管理軟件  1.6 計算化學應用  1.7  計算機化學的學習方法  1.8  相關網站及參考書第2章  ChemSketch的使用 2.1  ChemSketch概述   2.1.1  主要功能   2.1.2  軟件界面  2.2  結構模式    2.2.1  常用工具與快捷按鈕    2.2.2  基本操作    2.2.3  高級操作   2.2.4  二維優化  2.2.5  三維優化   2.2.6  模板的應用   2.2.7  模板的管理 2.3  繪圖模式   2.3.1  常用工具與快捷按鈕   2.3.2  反應能量圖   2.3.3  原子軌道圖   2.3.4  實驗裝置圖 2.4  分子性質的預測第3章  ChemBioDraw的使用 3.1  ChemBioDraw概述   3.1.1  版本介紹   3.1.2  運行系統要求   3.1.3  新特性 3.2  ChemBioDraw工具欄與文檔   3.2.1  工具欄與窗口顯示   3.2.2  文檔操作   3.2.3  頁面設置 3.3  ChemBioDraw操作實例    3.3.1  畫丙酮分子    3.3.2  使用環工具    3.3.3  畫反應式    3.3.4  畫中間體    3.3.5  使用碎片工具    3.3.6  畫多點配位結構    3.3.7  費歇爾投影式    3.3.8  畫透視圖    3.3.9  畫紐曼投影式    3.3.10  使用立體化學標記    3.3.11  使用模板 3.4  結構式的基本畫法  ……第4章 ChemBio3D的使用第5章 Gaussian的使用第6章 GaussView的使用附錄 能量單位
章节摘录
插图:第1章 计算机与化学计算机及网络技术的应用现已深入到化学研究的各个领域,使传统化学研究的手段和方法发生了深刻的变化。如今的化学研究已由纯实验科学,演变为先实验再计算、边实验边计算,直至成为先理论计算再实验验证、实验研究与理论计算相结合的全新科学研究模式,逐步形成了专门研究计算机技术在化学及其相关领域中应用的分支学科——计算机化学与化学模拟。1.1计算机与化学自20世纪80年代DOS操作系统问世以来,尤其是90年代中期Windows操作系统的诞生,加上计算机硬件技术的飞速发展,整个计算机系统得到了空前的完善,人类社会的生活方式也发生了革命性变化,互联网把整个世界连成一体,计算机不再是少数高级专门研究人员的特殊工具,已成为普通人群必不可少的工作平台。目前,化学研究人员可以在计算机上方便地开展研究工作,从而诞生了与计算机相关的众多化学分支学科,促进了研究手段、研究方法的不断更新和完善,并逐步产生了一些新的名词和术语,如计算机化学、计算化学、化学信息学、化学数据库等。
编辑推荐
《化學圖文設計與分子模擬計算》可作為化學及相關專業高年級本科生、研究生的教材和化學專業教師及有關研究人員的參考書,也可作為相關軟件的使用參考書。
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评论与打分
  •     里面有關于chembiooffice11的詳細介紹,也有關于gasssian和gview的操作介紹,對于剛開始做計算的同學來說是相當好的選擇。
  •     我看了此書關于gaussview的使用這一章節,我受益匪淺,值得想學gaussian的人去學習!!!
  •     學習一些基本軟件,還是有用的。
  •     書的質量不錯 內容詳細 對應初學的人來說是有幫助的
  •     內容介紹比較實用,比較適合初學者,對我幫助很大。
  •     作為新的學習內容買來的,挺好的書。
  •     寫的挺詳細的,自學的好幫手
  •     這本書還是不錯的,價格比較便宜,內容也比較好
  •     書質量挺好,就是後幾頁有點皺,不過紙張看著挺好的
  •     當當的書是最好的,而且價格也便宜
  •     這本書的印刷挺好,質量不錯。
  •     講課正好用上
  •     滿意、很有用!
  •     是一本好書。對于想要在應用量子化學方面入門的讀者有幫助,只是算例分析簡單。
  •     書很不錯~非常詳細~可是現在我用的已經是2010的12.0了~書中介紹的還是2009的11.0
  •     高斯部分的內容要再詳細一點就好了
  •     確實挺像萬金油的一本書
  •     這本書是入門級別的,很不錯,發貨速度也挺快的
  •     第一章寫得較好
  •     禮券好像沒送啊?
  •     這方面的書太少了,聊勝于無吧。
  •     入門級的,如果想深入了解,還得看其他的書
  •     還行吧。給學生看的。
  •     看了一下,有點萬精油的感覺
  •     感覺商品不錯吧,挺豐富。
  •     內容挺多的,適合新手上路
  •     範圍較廣,做為入門使用是不錯的。
  •     蠻不錯,內容詳細,適合初學者使用
  •     內容還行,滿意的!!
  •     書還不錯,就是應用方面的介紹不多啊!
  •     對學習化學的本科生,研究生來說都是一本不錯的書。
  •     這本書挺不錯的,從質量上來說。
  •     我了解作者之一,于是買下。各種主流化學軟件介紹的比較詳細。
  •     很不錯,深入淺出,介紹的也很全面!
  •     我是做合成的,外行呀,看看這書學到不少知識!
  •     這類圖書國內很少,對gaussian軟件做了介紹,紙張、印刷都很好,並且卓越價格便宜還免費送貨,是買書的好地方