分子模擬的理論與實踐

分子模擬的理論與實踐

图书基本信息
出版时间:2007-7
出版社:化學工業出版社
作者:陳正隆
页数:350
字数:384000
书名:分子模擬的理論與實踐
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分子模擬的理論與實踐
内容概要
分子模擬技術是一項廣泛應用于材料、化學、生化與藥物研究的通用技術.通過計算模擬,可以得出實驗無法得到的資料,因此該技術應用領域十分廣泛。但由于其公式較多,一直以來都令人感覺深奧難懂。本書在寫作過程中略去公式的繁瑣推導,力圖結合豐富的應用實例使讀者盡快掌握各種模擬方法的精髓。書中具體介紹了分子力學方法、分子動力模擬、蒙地卡羅計算及布朗動力模擬等方法。圖文並茂,實例生動。    本書適用于從事材料、生物化學以及藥學相關專業的研究人員,以及相關專業學生使用。
书籍目录
第1章 分子模擬的概況 參考文獻第2章 力場 2.1  力場簡述 2.2  力場作用項的一般式 2.3  常見的力場  2.3.1  MM形態力場  2.3.2  AMBER力場  2.3.3  CHARMM力場  2.3.4  CVFF力場  2.3.5  第二代力場 2.4  涵蓋周期表元素的力場 2.5  特殊的力場 參考文獻第3章 能量最小化 3.1  勢能圖與勢能面 3.2  函數的極小值 3.3  利用導數求極小值的方法 3.4  一次導數求極值法  3.4.1  最速下降法  3.4.2  共軛梯度法 3.5  二次導數求極值法  3.5.1  牛頓一拉森法  3.5.2  近似牛頓一拉森法  3.5.3  對角線塊狀牛頓一拉森法 3.6  求分子最低能量構象方法的選擇 3.7  能量最小化的應用 3.8  多原子分子振動頻率的計算 3.9  以能量最小化方法預測團簇體的大小 參考文獻第4章 分子力學的應用 4.1  分子結構與勢能面 4.2  勢能面的最小值點、最大值點、鞍點 4.3  勢能面與化學反應  4.3.1  過渡態結構與反應路徑  4.3.2  鞍點與二次區域  4.3.3  決定鞍點的方法 4.4  分子力學計算的熱力學性質  4.4.1  構象能  4.4.2  分子的生成焓  4.4.3  反應熱與生成焓 4.5  晶體結構的計算 4.6  立體效應 參考文獻第5章 分子動力模擬計算的原理 5.1  分子動力計算的基本原理 5.2  牛頓運動方程式的數值解法 5.3  周期性邊界條件與最近鏡像 5.4  積分步程的選取 5.5  簡化單位 5.6  分子動力計算流程 5.7  分子動力計算的初始設定 5.8  定溫計算法 5.9  系統形狀的改變計算 5.10  各種系綜的分子動力計算方法參考文獻第6章 特殊形態的分子動力學第7章 分子動力計算的應用第8章 分子動力計算的應用實例第9章 長程作用力的計算第10章 蒙地卡羅計算方法第11章 蒙地卡羅計算的應用第12章 蒙地卡羅計算的實例第13章 布朗動力計算方法第14章 耗散粒子動力計算法第15章 溶解自由能第16章 生化分子系統的模擬第17章 分子模擬與藥物設計附錄A 經典運動力學附錄B 統計力學附錄C 天然存在的氨基酸的結構索引
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评论与打分
  •     好書!值得研究!
  •     一本不錯的書.對于初學者很有意義
  •     一本很好的書易懂
  •     這是一本關于分子模擬的基礎性書籍,簡單明了,沒有一般分子模擬英文書的冗長的數學推導,適合初學者使用。其中對力場、分子力學及分子動力學的介紹尤其適合于初學者。
  •     對于初步涉及的讀者有點難度,但是很有價值值得熱終于"分子模擬"的學者品味!
  •     內容全面,易懂。讀完後,會對分子模擬有一個全面的了解。當當網對此書的包裝對書保護的很好。
  •     作為分子模擬的入門書籍不錯.如果折扣再多一點就更好了
  •     好書!值得研究!就是上面的理論太深了
  •     感覺是經典文獻的翻譯集。不過對于初學者來說我很喜歡
  •     圖書文字比較清晰,但是圖片質量太差,有些圖片(例如42、43、333-336頁)非常不清晰,大有抄襲之嫌!而且這本書的內涵不夠,有很多地方淺嘗輒止!讓人讀了模不著頭腦,沒味道。
  •     正版的,價格比學校書店便宜,送貨及時
  •     好對力場有全面的講述
  •     我做分子模擬的入門書啊,講得還算詳細
  •     該書偏重于生物大分子的模擬
  •     這本書的題目起得比較大,但實際上講的並不全面。對于做量子化學計算和第一性原理計算的人沒有幫助.
  •     正在看。可書中的錯誤實在太多,也許是校對的問題,但是這樣的書實在是有負陳正隆的盛名。
  •     一般。講的比較基礎,內容也少。
  •        這本書的內容和實踐這個詞差的太遠了。
       整本書基本上是列出了分子模擬用到的各種力場的表達式,卻缺乏實踐這個重要的東東。難為了書名的實踐這個詞。
       當然作為入門書是可以的,基本上是很入門的理論書了。從中可以了解到各種力場的優缺點,卻無法知道具體模擬的方法、軟件和過程。